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首頁 > 商務會議 > 學術/科研會議 > 宏基因組與代謝組/脂質組學R軟件數據可視化研討會 更新時間:2023-05-24T10:26:19

宏基因組與代謝組/脂質組學R軟件數據可視化研討會
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宏基因組與代謝組/脂質組學R軟件數據可視化研討會 已過期

會議時間:2023-06-23 09:00至 2023-06-24 18:00結束

會議地點: 線上活動  詳細地址會前通知  

會議規模:暫無

主辦單位: 上海遐錦生物科技有限公司

發票類型:增值稅普通發票 增值稅專用發票

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        會議介紹

        會議內容 主辦方介紹


        宏基因組與代謝組/脂質組學R軟件數據可視化研討會

        宏基因組與代謝組/脂質組學R軟件數據可視化研討會宣傳圖

        宏基因組與代謝組/脂質組學R軟件數據可視化研討會

        2023年6月23-24日 騰訊會議網絡會議室

        背景介紹

        微生物是自然界中分布最廣、種類最多、數量最大的生物類群。以腸道微生物為例,人體內微生物的總數量約是人體細胞總數的10 —— 越來越多的研究發現,腸道微生物與人體健康有著密切的關系,而微生物產生的代謝物是調控過程中最主要的中間遞質之一。

        宏基因組研究包括16s測序和宏基因組測序,可以獲得微生物群落豐度以及組成。通過分析可以獲得關鍵菌群以及功能,為疾病治療提供研究基礎。

        代謝組學和脂質組學是基于LC-MS液質聯用技術對生物樣本中的小分子代謝物/脂質分子進行定性和相對定量分析。嚴格來講,脂質組也是代謝組的一種。

        宏基因組-代謝組/脂質組的聯合分析能夠從多個維度闡釋一個科學問題,可以用來解釋差異菌群與差異代謝物的關聯性,從而幫助建立微生物-代謝物-表型之間的邏輯關系。

        基于以上原因,醫藥加推出宏基因組+代謝組/脂質組聯合分析R軟件實操課程,帶您充分挖掘數據,掌握生信高級分析能力。

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        主要內容詳細內容見下文日程表

        1. 宏基因組生信文章解讀與報告解讀;
        2. RRstudio軟件安裝,宏基因組與代謝組/脂質組學聯合分析實操;
        3. 生信SCI文章實用數據處理與圖片導出。

        【會議預期】

        本課程通過天的時間學習,讓我們對宏基因組腸道菌群分析,代謝組脂質組小分子分析,以及組學整合數據處理分析,有一個全面的了解。并使用R語言進行分析及可視化作圖,得到SCI水平的圖片。

        講師簡介

        宋偉博士

        成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數據庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創唐篩流程的開發。

        研究方向:有近十年的生信分析經驗,擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數據分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。

        培訓經歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場現場培訓班。

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        主辦方:上海遐錦生物科技有限公司

        會議時間2023年6月23-24

        會議地點線上:騰訊會議網絡會議室

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        收費標準:會務費:線上:2800/人;

        優惠政策:

        1.提前確認報名及轉賬的,可以提前拿到學習材料

        2.三人組團報名,每人優惠100元

        3.四人組團報名,每人優惠200元,

        4.人組團報名繳費,可免1人會務費!

        可以開正規會務發票,紙質邀請函(蓋紅章)。

        注意事項:必須攜帶win10以上系統的電腦,現場不得錄音錄像。上課軟件為R和Rstudio。會后主辦方會統一提供錄屏作為復習資料。

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        會議日程

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        宏基因組與代謝組學R語言分析及可視化會議日程

        時間安排

        課程表

        介紹

        第一天

        上午

        9:00- 10:15

        生信分析思路

        1. 生信簡介;
        2. 宏基因組,代謝組,脂質組簡介;
        3. 宏基因組生信文獻解讀;
        4. 宏基因組與其他組學整合文獻解讀;
        5. 國自然宏基因組代謝組撰寫思路;

        10:30-12:00

        R語言基礎

        1. R軟件與Rstudio軟件安裝;
        2. R基礎——類與對象(元素、向量、矩陣);
        3. R基礎——函數;
        4. R基礎——路徑修改、
        5. R基礎——文件導入;文件保存(圖表等);
        6. R基礎——R包及安裝后續實操

        第一天

        下午

        13:30- 15:15

        標準報告解讀

        1. 16s測序分析報告解讀;
        2. 宏基因組測序分析報告解讀;
        3. 代謝組分析報告解讀;
        4. 脂質組分析及報告解讀

        15:30-17:30

        宏基因組生信分析R實操(一)

        1. α多樣性分析;
        2. β多樣性分析;
        3. 物種組成柱狀圖;
        4. 物種熱圖分析綱目科屬
        5. LeFse分析樹形圖分析。

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        第二天

        上午

        9:00-10:15

        宏基因組生信分析R實操(二)

        1. 菌群無監督PCA分析;
        2. 菌群有監督OPLS/DA分析
        3. 差異菌群分析logFC , Pvalue;
        4. 差異菌火山圖與差異基因熱圖;

        10:30-12:00

        代謝組脂質組生信分析R實操

        1. 液相色譜LCMS的陽離子(POS)陰離子(NEG)模式分析;
        2. 代謝物的有監督和無監督聚類;
        3. 差異代謝物分析(logFC , Pvalue, VIP
        4. 差異代謝物火山圖與差異基因熱圖;

        第二天

        下午

        13:30-15:15

        宏基因組代謝組數據多組學整合生信分析R實操

        1. 功能通路富集分析氣泡圖
        2. 16s與代謝組整合共表達分析。
        3. ?;鶊D分析;

        15:30-17:00

        宏基因組代謝組數據多組學整合生信分析在線工具實操

        1. metaboAnalyst數據庫通路富集;
        2. Venn圖在線工具;
        3. Pathway map圖制作
        4. 疾病與菌屬關聯Disbiome database
        5. gutMDisorder | 疾病和干預中腸道微生物群失調的綜合數據庫
        6. GMrepo數據庫

        17:15-17:30

        答疑

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        示例圖展示

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        示例圖 箱線圖

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        示例圖 PCoA

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        示例圖 物種組成柱狀圖

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        示例圖 熱圖

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        示例圖 venn

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        示例圖 PCA分析

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        示例圖 差異結果

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        示例圖 代謝物的pathway map

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        示例圖 Lefse樹狀圖

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        示例圖 ?;鶊D

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        查看更多

        上海遐錦生物科技有限公司 上海遐錦生物科技有限公司

        上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫學Meta分析與網狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。

        會議日程


        即將更新,敬請期待

        會議嘉賓


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        參會指南

        會議門票


        票種名稱 價格 原價 票價說明
        會務費 ¥2800

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        溫馨提示
        酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
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          僅PC站支持。
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          根據會員等級的不同,每抵用1元可使用的積分也不一樣,具體可參見PLUS會員頁面。 僅PC站支持。

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